Forensic application of Y-chromosomal STR analysis in Lithuanian population
| Author | Affiliation |
|---|---|
Ruzgaitė, Giedrė | |
Lietuvos mokslų akademijos leidykla |
| Date |
|---|
2015 |
Molekulinės genetinės įvairovės dispersinė analizė pagal Y-STR žymenis atskleidė mažą, bet statistiškai reikšmingą genetinį atstumą tarp visų tiriamųjų populiacijų porų, išskyrus Lietuvos ir Latvijos populiacijų porą. Filogenetinės analizės duomenimis, Lietuvos ir Latvijos Y chromosomos genofondas pagal tiriamuosius Y-STR žymenis yra filogenetiškai artimesnis Rusijos ir Estijos nei Baltarusijos ir Lenkijos populiacijų Y chromosomos genofondui. Nustatyta, kad tiriamųjų Y-STR žymenų aleliai ir haplotipai gali reikšmingai skirtis tiek Lietuvos populiacijoje, tiek tarp Lietuvos ir kaimyninių populiacijų, išskyrus Latvijos populiaciją. Tai rodo, kad Lietuvos ir Latvijos populiacijos yra artimos ne tik geografiškai ir kalbiškai, bet ir genetiškai pagal Y chromosomos genofondą, reprezentuojamą JAV ir Europos teismo genetinės ekspertizės jurisdikcijose pripažinta Y-STR žymenų sistema. Taigi, daugiau Y-STR žymenų turėtų būti analizuojama siekiant diferencijuoti Lietuvos ir Latvijos Y chromosomos haplotipus. Lietuvos populiacijos genetinę struktūrą ir įvairovę reprezentuojantys Y chromsomos STR haplotipai įtraukti į tarptautinę Y chromosomos STR populiacinių palyginamųjų duomenų bazę, naudojamą teismo genetinėje ekspertizėje „Y-STR Haplotype Reference Database 3.0“.
This paper presents a comprehensive Y-chromosomal STR haplotype analysis in the Lithuanian population in order to evaluate Lithuanians’ Y chromosome diversity, to infer genetic relations between Lithuanian and other European neighbouring populations and to introduce population reference data for generation of reliable Y-STR haplotype frequency estimates to be used in the quantitative assessment of Y-STR haplotype match in the forensic casework Data were collected from the peripheral blood samples of 194 unrelated males throughout various regions of Lithuania. The amplification of 17 Y-STRs was carried out in one multiplex PCR using an AmpFZSTR® Yfiler™ PCR Amplication Kit according to the suppliers protocol. The results indicated that the Y-chromosomal haplotype diversity in the Lithuanian population rises as the number of the analyzed Y-STRs is increased. However, all additional Y-STR loci are not hypervariable and only their whole makes a large diversity of Y-STR haplotypes in Lithuanian males. The analysis of molecular variance revealed low but significant interpopulation differences except the pair of Lithuanian and Latvian populations. The phylogenetic analysis showed that the clustered Y chromosome gene pool of Lithuanians and Latvians has a closer phylogenetic relation to Russian and Estonian populations and is less genetically related to other neighbouring populations of Belarus and Poland. Yet Y-STRs alleles and haplotypes differentiate effectively inside the Lithuanian population and between Lithuanians and its geographical neighbours excluding the Latvian population. [...]